全轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒?/strong>概述

全轉(zhuǎn)錄組測序（Whole Transcriptome Sequencing, WTS）是一種高通量測序技術，旨在全面分析特定細胞或組織在某一功能狀態(tài)下所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA（mRNA）、長非編碼RNA（lncRNA）、環(huán)狀RNA（circRNA）以及微小RNA（miRNA）等。這項技術能夠揭示基因轉(zhuǎn)錄本的多樣性和復雜性，對于研究基因表達調(diào)控、非編碼RNA的功能、細胞信號傳導、基因功能鑒定、新發(fā)現(xiàn)基因、發(fā)育生物學、疾病機制、藥物治療以及微生物組學等領域具有重要意義。

全轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒?/strong>的技術流程

全轉(zhuǎn)錄組測序的技術流程通常包括樣本處理、RNA提取、文庫構(gòu)建和高通量測序。文庫構(gòu)建分為小RNA文庫和去除核糖體的鏈特異性文庫，分別針對不同長度和類型的RNA分子進行優(yōu)化處理。測序后，通過生物信息學分析，研究者可以獲得關于不同RNA分子的序列信息、表達水平、剪接變體、調(diào)控網(wǎng)絡等多方面的數(shù)據(jù)。

全轉(zhuǎn)錄組測序的應用

全轉(zhuǎn)錄組測序在臨床醫(yī)學中的應用日益增多，它可以用于病原體檢測、疾病相關基因變異的識別、藥物療效評估和預后分析等。此外，全轉(zhuǎn)錄組測序還能夠幫助科學家們在單細胞層面上研究細胞異質(zhì)性和動態(tài)變化，為個性化醫(yī)療和精準治療提供數(shù)據(jù)支持。

最新研究進展

近期的研究進展顯示，全轉(zhuǎn)錄組測序技術正在向著更高的空間分辨率和臨床應用方向發(fā)展。例如，耶魯大學樊榮團隊報道了全球shou個臨床級福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）樣本空間全轉(zhuǎn)錄組測序技術——Patho-DBiT，該技術能夠?qū)崿F(xiàn)對FFPE復雜組織中豐富的RNA生物學信息的空間解碼，包括單細胞級mRNA圖譜、非編碼RNA表達、可變剪接、遺傳變異等。此外，還有研究開發(fā)了新的單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序方法scFAST-seq，該方法能夠高效捕獲mRNA和不帶有poly-A尾的RNA，如lncRNA，并結(jié)合target region enrichment技術檢測單細胞水平的基因突變和基因融合。

這些最新的研究成果不僅推動了全轉(zhuǎn)錄組測序技術的發(fā)展，也為未來在生物醫(yī)學研究和臨床診斷中的應用打開了新的可能性。